依據衛生福利部疾病管制署歷年監測國內疫情資料顯示，腸病毒疫情每年約於5月底至6月中達到高峰後，即緩慢降低，而後於9月份開學後再度出現一波流行，患者以5歲以下幼童居多，嘉義市衛生局廖育瑋局長籲請家長及嬰幼兒照顧者須加強家人及兒童做好個人衛生、注意居家環境清潔及消毒；大人外出返家務必先更衣，摟抱、餵食嬰幼兒前，應以肥皂正確洗手，家中幼兒如經醫師診斷感染腸病毒時，應落實生病不上課，避免與其他嬰幼兒接觸，以降低交叉感染的機會。
截至8月16日，全國共計8例腸病毒併發重症確定病例，分別為4 例 克沙奇 A4 型、 2 例克沙奇 A6 型、 腸病毒 D68 型及伊科病毒 21 型各 1 例，均為5歲以下幼童。近期疾病管制署實驗室監測顯示社區腸病毒以克沙奇A型為主，腸病毒71型、腸病毒D68等多種型別腸病毒亦於社區活動，仍須留意相關防護措施及注意腸病毒重症前兆病徵。
在所有腸病毒中，除了小兒麻痺病毒之外，以腸病毒A71型最容易引起神經系統的併發症，但是嚴重程度各有不同，有的只出現腦膜炎、輕微腦炎、肢體麻痺等非致命性的併發症，有的則會造成死亡病例。一般而言，感染某一型腸病毒之後，對該種特定病毒之免疫力至少可持續數十年之久，但對於未曾感染過的病毒型別，仍有可能被感染發病的風險，千萬不能大意。
依據疾病管制署公告的資料顯示，目前國內經食品藥物管理署核准上市的腸病毒A71型疫苗廠牌有2種，皆屬細胞型不活化疫苗，適用滿2個月以上至未滿6歲幼兒，可預防腸病毒71型造成重症的風險。但對於其他腸病毒型別，如克沙奇A16、腸病毒D68型等，未有資料顯示具有交叉保護效力，嘉義市目前有19家醫院診所提供自費疫苗，如有接種需求，可至醫療院所洽詢，經醫師評估後自費接種。
衛生局提醒，5歲以下嬰幼兒為腸病毒重症高危險群，如發現有嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力或麻痺、肌抽躍（無故驚嚇或突然間全身肌肉收縮）、持續嘔吐與呼吸急促或心跳加快等腸病毒重症前兆病徵，請儘速送到醫院就醫，掌握黃金治療時間，嘉義市的腸病毒重症治療醫院有「嘉義基督教醫院」及「天主教聖馬爾定醫院」。民眾如有相關問題，可參閱疾管署全球資訊網(http://www.cdc.gov.tw)或至衛生局網站/疾病管制科/ 傳染病防治/腸病毒防治/疫苗接種相關訊息(https://health.chiayi.gov.tw/cp.aspx?n=6039)查詢或撥打嘉義市衛生局諮詢專線05-2341150洽詢。